ということで、rubyの本を引っ張りだしてきてる今日この頃。

/までと、index.html付きがあるのに気づいた。後者経由で、id:hisaom さんの生命動態システム科学にかんする良エントリを知った。そちらもぜひご覧ください。後日感想エントリあげる事になるかな。

人数も質疑も、驚く事に質疑する年齢層も、通常この行動で行われる事と全然違った 説明が出来ないような難しい事をしてる部分はあるだろうけど、説明できる研究を。 この研究に関しての話に関してだけでなく、もっと大事な話もなされていたと思う。 日本の(…

(筆者注: サイエンスの話ではないので、メモが雑になっています。ご了承ください) 事務局による推進体制たたき台 総論と体制 総論 推進すべき生命動態システム科学とは? 細胞の動的理解を目指す基本戦略 体制 必要性 分析をしていたが、統合的な理解が挑戦領…

提言のまとめ パネル1: 研究課題の科学的な検討 パネル2: 推進体制の提言 座長から 局面突破について from ueda, quo vadis? 細胞の上下の階層；組織、分子 計測から情報へ 流れは明確ではない この点について 逆転させてみては 邪道かも知れないが、本質を…

mol bio bioからの創薬への展開 満足度と薬の貢献度のプロット 満足度と薬の貢献度が低い疾患の克服 新薬RDの概況 (抜け部分) 新薬の研究開発プロセスと成功確率 シードの探索効率化は、企業努力で何とかなるかも 開発中止の理由 合理的な創薬プロセスへ こ…

acknowledgement metabolic systems: target of gaseous mediators? 簡単な一次代謝マップ 所々不可思議なガスが出てきてる 小さい分子とどう相互作用しているか、これも難しい ネガティブフィードバックが大事なのだけど、 そういうエッジは思わぬところに…

細胞の確率性と個体の安定性 ヒト一細胞の発現量変化 最初の変動 途中からは分布 細胞表現型の揺らぎ 一卵性双生児 個体表現型が安定 疾患は細胞のまれな表現型から 生命系と人工系の遺伝子発現揺らぎ 微笑空間の確率性の要因 揺らいでてもロバスト!! 細胞質…

80年代のがん遺伝子研究 シグナルパスウェイ、実際の信号伝達はppiだろうと 2000年頃のupdte 予測と実験が一致しないとだめだおる シグナルパスウェイをシステムとして捉える in -> sys -> out 増殖因子等 -> cell -> 現象 細胞の中が分かってないせいで、 G…

rna sailencing at drosophila miRNA: ~20~ small rna's, RNAi や他の機能 argo argonaute + small RNA -> risc complex small RNA sequencing by next gen sequencer 454, solexa, solid, heliscope small rnaの機能(以下しばらく抜け多し) animals edogenu…

寝坊しました...orz

例によって例のごとくぐだぐだした前置き 2010-05-07 - bak_a_monoの日記の続き、生命動態システム科学二日目のめもです。前置きもそちら参照でw

不参加です...

物質科学；マルチスケール階層アプローチ 分子や集合体の基礎方程式 シュレーディンガー方程式 diracの予言 複雑過ぎて解ける望みのない方程式に行き着いてしまう事である コンピュータによって何とかなった コンピュータの発展と電子状態計算 top500topの速…

計算機シミュレーションと生物学 活躍出来る対象；非線形非平衡非可積分複雑他界層 生命システムの特徴；階層複雑多様非線形非平衡 本来やりやすい モデル不在不完全、定量化の進展で対象増加 過去半世紀の計算機の発展 次世代スパコン 次世代生命体統合シミ…

複雑系生命科学 部分と全体が互いに影響し合うシステムの研究 当初から構成的 生命とは何か、を定量的に定式化して答える時 普遍的に見られる現象の、階層をまたがる動態 階層間の相互作用が多い 分子細胞多細胞個体生態系 構成的生物学 vs synthetic biolog…

dbの意義 ゲノム、タンパク構造、発現、相互作用、.... データだけでなく知識、手法、検索、解析ツール込み 研究のインフラ 研究の目的はデータベース作りだ! データベース生物学のこころ インフラ＆フロンティア そうすると、戦略を立てられるし、再利用可…

シグナルpropagation from local to global ex. taichu probe rasの活性をリアルタイムで見れる egfとレセプター、下流を見れるように localとglobal 局所的な結合が，globalに非依存的な結合を引き起こす、という報告 overexpressionに伴う問題->下流の分子…

システムと分子 / 生物らしい分子機構 システムの階層性 タンパク分子を引っ張って折りたたみを壊す力を調べる 分子間力顕微鏡による力ー伸張曲線 イベントが確率的に現れる 中間構造をシミュレーションで 経路自体が確率的 エネルギー地形も確率的 構築要素…

ダイナミックな形態の変化を追っていた 現象は分かるけど、分子変化は? 可能なら役に立つ道具に MSでやろうとすると、感度が足りない 10umm 1plm 1amolしかない 質量分析は分子のイオン化が鍵 ナノスプレーイオン化法 やってみると スペクトルの差はあった …

21世紀はバイオの時代 理化学機器では「２番手じゃ」だめなんですw 後追いは開発コストがかかるが、日本では他で話題になったものばかり シーケンサー開発の流れ 大容量でランニングコストの安いもの 小型で安いもの これまでのデータは多くの細胞から得た平…

生命科学の進展 主に要素の研究であった 進化した新しいシステムバイオロジー 現在のシステムバイオロジー、OMICS解析など 次世代のシステム科学 生命動態システム科学、ダイナミックモデルを作り、予測・デザインを行う 何故今か 定量計測の進展 計算技術 …

事業仕分けと政府の成長戦略について

(生命動態システム科学については?)ライフサイエンス委員会でも議論があった 金澤先生が総論だったのでこちらは各論で LTPと記憶 (抜け部分)*1 それだけではない 報酬と忌避の選択 記憶だけでなく、空腹度合いなど総合的に決まる-> システムの理解 サザラン…

background ゲノムも解読された 次世代の解析 従来のバイオ、では収まらない 全体の解析 日本学術会議の動き ライフイノベーション、グリーンイノベーション ライフサイエンスがこれを支える ブレーンストーミングの会としても有意義であって欲しい

例によって例のごとくぐだぐだした前置き 以前 http://d.hatena.ne.jp/bak_a_mono/20100211/ のエントリをあげましたが、「生命動態システム科学」シンポジウム 概要に行ってきたので、メモを最小限の編集でup。macbookの電池が怖かったので、macbookを眠ら…