(セッション3:【分子細胞生物学からの展開】)「再構成系でみる遺伝子発現」四方 哲也（大阪大学 ： 合成生物学）
細胞の確率性と個体の安定性
- ヒト一細胞の発現量変化
- 最初の変動
- 途中からは分布
- 細胞表現型の揺らぎ
- 一卵性双生児
- 個体表現型が安定
- 疾患は細胞のまれな表現型から
生命系と人工系の遺伝子発現揺らぎ
揺らぎの生物学的意義
- オペロンを再編成して、人工発現系から
- HisC
- 下流の遺伝子が必要なばあい、適応的に
- 振れた結果が都合が良ければ、それを採用するw
生命系と人工系の制御システムの比較
- 生命系/人工系 vs 全体/要素(間の関係)のマトリックス
まとめ
- 揺らいでる
- 細胞モデルでは粗い計算でいいのでは
- 揺らぎによって、発現が適応的に変化する
- プログラムに依存しない生物らしさ
作って分かる生物学
- より簡潔な要素から生命機能を再構成
- 失敗とデザインの比較-> 基礎ルールの解読
構成的アプローチの例1(kita et,al , 208)
- 人工細胞モデル; 144高分子、
- 基礎的質問；複雑なネットワークはどういうデザインに?
構成的アプローチの例2
- 多細胞モデルを作りたい
- 細胞の確率性を超えてなぜ集団がロバストになる?
作って分かる生物学
- QA
- (抜け部分)
- もっと大きくずれる
- 発現の揺らぎのタイムスケールが大きいので、こういうことが起きる
- 予想してこうしたのか、
- この件に関しては、こうなると思ったw ただ、別の質問を解いてしまった事も結構多いw
- 細胞間ネットワークと物質生産
- 現場の話を聞くと、系が不安定だ、安定化する原理がみつかれば。数理モデルは一応あるので、貢献できる可能性がある
- 昨日からのキーワード揺らぎ、エピゲノムの話も。どう関わるか
- それだけでなく変異率を考えると変わってる筈で、ソレを個体がどうかんりしてるか、と考えてる
