2008-01-01から1年間の記事一覧

awasete

しばらく前に、kaeru-san(もしくは、はてな id:gomi-boxさん)のawaseteにここが乗ってたとか、ここのawaseteにそこがのってるとか、幻に違いない。 # ってか、その前にカキコ自重>ヲレ [private]サイトウサンTシャツ 去年バージョンってどっかでデザイン見れ…

案の定忘れてた

久しぶりにRを起動する。と、すっかり書き方忘れてた…。 あっちみたりこっち見たりして、かろうじて目的を達成する。 だって、localのRHEL3だとRcommanderがこけるとかいろいろあって、使う意思が減退してたんだもの… [ヲレのバカ]そのうえ せっかく買った"…

ばかまるだし

今までずっと、カテゴリの記法間違ってたよママン…

転写物と転写産物

いや、単に言葉の話。 どっちが多いのかなと思って検索してみると、少なくともはてな内では転写産物の方がずっと多いっぽい。 今まで、転写物、だけ使ってた。 id:Yunokawa氏が偉大なのか、それとも漏れのずぼら好きのせいか、というところ。

構成学

やっとNo.2Vol.1 No.2に目を通す。結構面白い。

一卵性双生児でも、copy number variation(CNV)が違うって?

日経サイエンスのnewsで読んでびっくり。 ところで、少し前から不思議だったのは、これとSNPのかかわり。 コピー間でmutationの入り方が違ったりしないのかねぇ。 コピー間で、どない発現制御してるのかとか、凄く不思議。 掲載誌と著者までは日経サイエンス…

fRNAdbが

3.0になるらしい。今はまだBetaなので、ここからまだ機能が増えていく、らしい。

ucscな愚痴

転写物のマッピングデータとして、ucscなデータ*1をMySQLに突っ込んでみたのだが。 …なんでall_mrnaテーブルとrefGeneテーブルのスキーマがあんなに違うんだー!!クエリ書きにくいじゃないか!!バカヤロー!! *1:ftp://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg18…

blast

先日まで、職場でblastしてたのだが、こんな事もあるのね、というのをいくつか。 1プロセス4Gでは足りない ある日出勤すると、クラスタのノードが死んでた。クラスタの管理者に聞くと、他のノードを再起動して来たところだと言う。あらあら、やっちまった。…

気がつけば

15000PVを超えてる。まあろくな事書いてないのにこれって、凄いねクローラーのアクセスって。 # 良いのかそれで>ヲレ

2月某日、本郷

近いので、 本郷キャンパス内某所へ行く予定にしてたのだが、しっかり迷う。 気付いたら、 総合研究資料館前。科博で残した3フロアと合わせて、も一回上野に来る必要があるな。 電話で、 道順を某師に教えてもらって、某所着。そして、某師にこのブログがし…

2月某日、上野

前日夜 はてなリングBIな人が、行った記事を上げてる…。 初上野。 田舎もんじゃけんのう。 日本館で、 前後を回ってた女の子二人組な会話が面白かった。科博に誰かと行くって想像してなかったけど、いいなあ。 11時に入館 したのは大間違い。新館の半分、3フ…

cell b/eなブレード

自分用にメモ。 QS21、発売してたんだね。 http://www-06.ibm.com/jp/government/hpc/campaign/ 値段も出てる。ふむふむ。 bio*なライブラリ使ったスクリプトがさくさく動くならうれしいのだけど、fixstarsとか見てると、さすがにそれは期待しすぎだなあ。 c…

近刊情報

bioinformatics.ring.hatena.ne.jp経由http://sysevo.org/ogishima/blog/から。 BI本近刊情報 「オープンソースで学ぶバイオインフォマティクス」東京電機大学出版局(2007) これは欲しいな。買おう。けど、2008じゃなくて? 追記1@2008/02/22: まだamazonにな…

Re: 通信事業者は「ただの土管」にならないためには何をすれば良いのか?

問題意識は判るんだけど、ただの土管と契約できなくなったら、それはそれで困る。 いや、多分ただの土管として使う事は出来るんだろうけど、そうした時に異様にコストパフォーマンスの悪い土管になってしまう、のは容易に想像できる。 ただの土管に徹する事…

Re: はてな再上洛

で、なぜ京都なのか。 京都って、ベンチャー企業を育てる街である事でも有名だったり。いや、日本の都市としてはね。 歴史ある都市で地縁みたいな古くさいもの引きずってもいるのに、新しいものへの感性は東京より鋭い、と思うぐらい。 まあthe netのおかげ…

論文のコスト

ヲレには東大を擁護する理由はないのだが… これらのコストの内、open accessのコストを抜いて生産性を比べたらどぉなるんだろう。

しかし壊れ過ぎ / broken, too many...

先日レッツノートがおかしいと書いたが、今度はVTZが壊れた。世の中うまくいかなさすぎる。 before i wrote about the touble of "Let's Note"-notePC by Panasonic-, but now, my 250cc motercycle VTZ was broken. there are too many trouble... こういう…

生化若手の会関東支部交流会

mixi::生命科学コミュ経由。バイオインフォマティクスもありな交流会。 http://seikawakatekanto.hp.infoseek.co.jp/ATGC/ …基本的にB4M2D3で、基本的に発表か… 今やってる事って勝手に外部発表出来んから、見送るしかないか… # 行きたい理由は、一度箱根に…

しかし

ヤヴァイわ、ヲレ時間の使い方何とかせんとアカン。

Re: [memo][comp] 「汎用京速計算機と戦艦大和」について言いたいことが

以前、池田氏のblogエントリみて感想書いたのだが、そこで引用されてた牧野先生の所にいろいろ書いてある… 以前のエントリ;http://d.hatena.ne.jp/bak_a_mono/20071123 牧野先生のところ;http://grape.mtk.nao.ac.jp/~makino/articles/future_sc/note058.h…

最小ゲノムセット

id:Hash氏の解説でやっと判った。THXです>>Hash氏。 利己的遺伝子(の一つトランスポゾン*2)を使って、本質的に重要な遺伝子と不要な遺伝子を分けたらしい。 あちゃ、これ見落としてたのは痛い。といっても、今日の夕方投げたメール書いた後でないと、気付…

久しぶりにトラバを頂く

id:Hash氏の所にコメント付けたが翌日見ても返事がなく、あれ、コメント早い人なのに、と思っていたら。 1月10日のエントリ(d:id:Hash:20080110)にコメントをいただいて色々考えていたら、一つのエントリレベルまでふくらんでしまったのでこちらに上げます。…

げ、レッツノートの / Oops, Let's note

液晶バックライトが点かない。 Back light does not tuned on. …昨日amazonで安いノートPCなんて見てたからか? is it caused by the seeing cheap notebook pc in amazon.com, last night? そういう事言うパソコンはMacだけだと思ってたのだが。 Only Mac sa…

perlデバッガ/Devel::ptkdb

perlのデバッガに、ptkdbというtkツールキットを使ったGUIデバッガがある。こいつがRHEL3でおかしいのは、RHEL3の出来が悪すぎるせいだと思っていた。 there are debugger named "Devel::ptkdb", using tk toolkit, as a GUI debugger of perl. sometimes th…

R言語本、購入

11/13に2chで評判のいいものを抜粋したけど、結局「Rで学ぶクラスタ解析」になった。最初に、最低限以下の事に絞ってRの書き方について書いてあるので、たまにRを使う人にはコレがよさ気。「The R Book」(日本人が書いてるほう)は古本で用意してるし「統計解…

そのうち

続きを書くかもしれない。かけないかもしれない。

今日の早川さん

早川さんって十分魅力的だと思うのだけど 正月休みに、「今日の早川さん」を読み返して、web版もみた。 ヲレ、早川さんってかわいいとおもうんだよね。 …早川さんが「もてない」って、話が終わらないようにする都合?とか思うぐらい。 たとえば「大物捕獲」の…