『細胞内・細胞間の遺伝子ネットワークを理解する』上田 泰己(理化学研究所)
細胞機能を再構成・設計する
- 20世紀最大の発明
- CPU
- Cell
時間の分子生物学
- 不可逆性
- 反復性
不可逆性
単純から複雑への時間の矢
- 記憶・学習・気分
反復
体内時計
- 中枢時計と末梢時計
- ルシフェラーゼな動画
- 同調と細胞間相互作用
体内時計の3つの性質
- 振動
- リセット
- 温度補償性
cdbに上がってるムービー
cdbの考えるシステム生物学
- 同定
- 解析
- 制御
- 設計
細胞の中の時計
- 時計関連遺伝子の同定
- 遺伝子ネットワーク// activator, repressor計20
- 朝昼晩3つのスイッチ
非連続でなく連続なのは?
- 組み合わせ
- 人工的な部分で検証できるか?
- ほ乳類培養細胞内に、promotor, activator, repressor
- 昼、夜の転写出力の設計
- 様々な転写出力の設計
- 再構成実験の結果、連続は作れるだろうとわかった。
- まだ朝が作れない
一日48時間にする
- 朝のrepressorの遺伝子?
- 温度は?
- 温度補償性のある酵素だった
細胞集団としての時計
シンギュラリティ
- 夜中に光を当てると時計が止まる!?
- 進化的な保存
- 停止、脱同調
- 実験的な難しさ
操ればいいのでは?
- 時計細胞に光り受容タンパクを
- 試験管の中で時計を止めて、再び動かすことに成功(ただしばらけてる)
- 心臓が止まるときと似ている
- movie
組織としての細胞
- 相互作用の数理モデル
- 再構成でこれを解き明かしたい
- ヘプチドを発現させて、位相制御