シンテニー
シンテニー領域を取り出すツール
シンテニーという言葉はしばしば聞くが、実際にあーやってこーやって、というチュートリアルを見たことがない。バイオインフォな本も何冊か持っているが、そっちにもない。
UCSCにliftoverというツールがあるが、「異なる生物種間での変換はお勧めしない」と事あるごとに出てくる。しかもパラメータ変えて実行すると、セグメンテーションフォルト。
…皆さんいったいどうやってるのか、教えていただけるとありがたいです。
というか
こういうツール、ささっと作ってBioinformatics(oxford)のapplication noteにでもしたら、結構引用数とかダウンロード数とか上がりそうな気がする。誰かやって欲しいと切に願う今日この頃。
外部リンク(追記:2007/07/28)
外部リンク、良いというほどでもなかった。残念。
