2007-01-01から1年間の記事一覧

バイオインフォマティクス技術者試験の終了

キーワードつながりで、はてぶの中http://d.hatena.ne.jp/hiro_5050/20070321/1174442487で発見。

ところで、

フィルタって、デザインパターンの適用対象になったりするのかねえ。

R

手付かず。BioConductor本の発売待つか? # ってことは、上記どちらかを発売までに済ます気かい>ヲレ

Squeakのコミュ

があるのに、聞いてから気付く。しかも、umejava氏自ら、SeasideJOneのアナウンス投げてるし。こっちで聞いたほうが良かったか。

その後寝て起きた晩

mixiのSmalltalkコミュには、結構知られてる人がいるのを思い出し、誰か情報持ってないのか聞いてみる。

"SeasideJOne"と"Happy Squeaking!!"

を引っ張り出して、ちょこっと勉強の真似事なぞしてみる。と、第1回3-3.2で、いきなりつまずく。新規プロジェクトとしてMVCを選べと書いてあるが、それが出てこない。…日本語化のせい、ということもないだろうし、Seasideフレームワークなら余計MVCモデルの…

たのしいRuby

ざっくり見る。が、マシン持たずにミスドで読んでても意味ねえなあ。

というわけで

情報募集。XX見たら載ってるとか、クックブック見れとかという情報でも桶。

いまヲレがどうやってるかというと

関数内で、 改行コードをundefに データの読み込み 改行コードを\nに データを、CR+LF/LF/CRの16進表現に引っ掛けて 当たった16進表現でsplit みたいな処理。 最初に試したのはchompの置き換えだったんだけど、そもそもreadlineの時点で問題が起きる場合もあ…

Encode::Guessがあるのは良いけれど

Perlのというかプログラムからの改行コードの扱いって、もう少しどうにかならんもんか。 Linefeed::Guess見たいなモジュールが欲しい。 Mac Classic環境の改行コードなどはCRだったせいで、現在もMacOSXでの改行コードには多少の混乱がある、と言って良いと…

instant RailsとSeasideJOne

を落として、ひとまずSeasideJOne入れた。 単なる日本語Squeak環境としても使えるというところがいい。 思わず職場のRHEL3なマシンにも入れてしまった。 はてなringバイオインフォ界隈ではやってるのはBioRuby+Rails(というかActiveRecord)だと判ってはいる…

あ 追記@04/07

フィルタって、現実世界でも独立したオブジェクトやんか。なにボケてんねんヲレ。

オブジェクト指向と、「データベース」

Bio+ITな仕事をお手伝いしてると、テキストファイルのパーザ書いたり、RDBにあれこれお任せしたりjoinしたりというのが多いのだけど、別のスレッドなオブジェクトが相互作用してるようなイメージで、コードを書いたことがない。なぜそうなのか少し思い当たっ…

オブジェクトの相互作用

ってそれ自体は十分わかりやすいと思うんだけどなあ。 まあこんな話が出てくるから、「オブジェクトファースト」な教科書も出てくるわけで。 一方で思うこともあったり。

元エントリを

良く見たら、予価と発売予定までほのめかしてあった。…漏れ、この数カ月寝てたかも。

Bioconductorは

はてなのキーワードになってないみたい。まだ早いか…

mogr本(というらしい)の出版社他

職場で少し空き時間があったので、適当にキーワード探りながらぐぐってみた。 仮title: 「R と BioConductor を用いたバイオインフォマティクス」 出版社: シュプリンガージャパン という辺りはどうやら決定っぽい。 …情報出ないわけだ、シュプリンガーのサ…

PASMOキーパーソンは、Suicaしか語らない

いいもん、PiTaPaまで相互利用出来るようになるまで、PASMOもSuikaも使わんから。

「イスラム金融を勉強する10冊」に和書がない

単に洋書からだけ選んだのならいいけれど、和書にマトモなイスラム金融の本がない、という事態を反映してるなら恐ろしい。イスラム金融に限らずアラブ社会について、日本ではあまりに知られてないと思う。

[poison]電話勧誘

内線に直接かけてくるかなあ。 適当に作ったな、内線番号。

そもそも

知ってるヒトなぞほとんどいないはずなのに、なにゆえアクセス数がこんなにあるのか、超不思議。

それ草で

ググってみたら、何故か結構上位。なにゆえ。

無償SDk

といっても、携帯向けLinuxの話。けどこれ、デスクトップで便利な使い方ないのかな? # と、フィルタ代わりのperlスクリプトしか書かないやつが言ってみるテスト。

カンマの制限は本末転倒だってば

> 5 Abe, Shinzo これがダメな理由として、 > 5も悪くないが、csvデータなどではカンマが混乱のもとになる。 tabでええやん。タブ区切りテキストとか.tsvファイルとかいうけど。 エエカゲン、カンマ区切りやめようよぉ…カンマ区切りって、グローバルスタンダ…

ダイオキシン

人間への毒性はベトナムで立証されてます、といったらまずい事になるんだろうなあ、LD50が量れるような状況ではないもの。ダイオキシン自体は猛毒だという認識でおります、特に2,3,7,8-TCDD。一方で、焼却炉のリスクが低いのは同意。上記のダイオキシンに分…

エントリの本題と関係なく大受けしたネタ

> …石原氏の対抗馬として(馬ってったってメタファーですから、メタファー)建築家の… 馬がメタファーなのをわざわざ断ってるところ、テラワロス

理沙

ってことで、リサイクルコーナーに載りまくり。

ソレクサ

ってか、ソレクサのシーケンサ、うちで買うんちゃうかったっけ。納品遅れたりしないのかねえ。 # あ、去年の話だった。

SAGE以外

発現解析として、タグの数を数えるテクノロジーがSAGE以外にもあったのは知ってた。 で、あるネタで調べてたらMPSSというテクノロジーを使ったペーパーに当たった。 ペーパーには、データはwebサイト参照、とあって見てみたらその会社がソレクサと合併し、更…

CAB: Cell Accelerator Board

PC watchでメニイコアCPUの話が出てて、 http://pc.watch.impress.co.jp/docs/2007/0221/kaigai339.htm 興味深く読んだのだが、もっと面白かったのはそこに付いてるGoogleADだった。 CAB: Cell Accelerator Board http://www.mish.co.jp/cab.html メモリでけ…